Wetenschapsstage Klinische dataverzameling voor speekselkliertumoren
- Bedrijf
- Leids Universitair Medisch Centrum (LUMC)
- Type
- Stage- en onderzoeksplaatsen
- Locatie
- Leiden
- Branche / Vakgebied
- Onderwijs
- Vereiste taal
- Nederlands
Omschrijving
Stageomschrijving:
Het stellen van een juiste diagnose bij speekselkliertumoren is vaak een uitdaging. De WHO-classificatie beschrijft momenteel bijna 40 verschillende typen tumoren, waarvan vele zeldzaam zijn. Dit maakt het voor pathologen moeilijk alle varianten te herkennen, waardoor het risico op een onspecifieke, onjuiste of vertraagde diagnose toeneemt. Omdat AI veelbelovend is om de diagnostiek te ondersteunen, wordt er onder leiding van het LUMC gewerkt aan de SALV-dataset: de grootste, zorgvuldig samengestelde digitale beeldbank van speekselkliertumoren ter wereld. Deze bevat digitale microscopiebeelden (whole slide images) van tumormateriaal, klinische gegevens van patiënten en gereviseerde diagnosen, vastgesteld door een team van expertpathologen. Het handmatig verzamelen van deze klinische gegevens uit elektronische dossiers is echter zeer tijdrovend, zeker gezien het gaat om duizenden casussen afkomstig uit meerdere medische centra.
In deze stage onderzoek je of CTcue, een no-code tool die in veel Nederlandse ziekenhuizen beschikbaar is, kan worden ingezet om deze data automatisch te verzamelen. Je maakt eerst een handmatige referentieset en ontwikkelt vervolgens een zoekstrategie in CTcue om dezelfde gegevens te extraheren. Door beide te vergelijken beoordeel je de nauwkeurigheid en bruikbaarheid. Bij succes onderzoek je ook de toepasbaarheid in andere centra, waarmee je bijdraagt aan efficiënte en gestandaardiseerde dataverzameling voor SALV en toekomstige multicenteronderzoeken.
We zoeken een geneeskundestudent met interesse in KNO en datagedreven onderzoek. Het project is ideaal voor studenten die geïnteresseerd zijn in de koppeling tussen klinische geneeskunde, data science en AI.
Vakgebieden: pathologie, KNO/kaakchirurgie, AI
Periode: minimaal 16 weken, met mogelijkheid tot verlenging
Voor wie: studenten Master Geneeskunde
Begeleiding en contact
Danielle Cohen (principal investigator, hoofd-hals patholoog)
Jurre Weijer (PhD student)
Sylvia van Egmond (KNO arts)
Afdeling Pathologie
Leids Universitair Medisch Centrum